Марина вручную, согласен, это делать не будешь, т.к. если Ваш сайт станет популярным и оборот средств будет значительным, то Вы только и будете делать, что переводить деньги.
WebMoney - хороший выбор, популярная система в России, хорошая защита от атак, есть лимиты доверия и так называемые BL - бизнес уровни, которые будут характеризовать Вас как хорошего (или не очень - это только от Вас зависит) человека/владельца сайта.
Яндекс деньги - тоже популярная система, однако, ВМ все-таки превосходит ее. По лично моему мнение есть солидные недостатки, тем более если использовать регулярно в автоматическом режиме для совершения различных операций, в том числе и крупных.
Теперь еще 2 системы:
PayPal и
Liberty Reserve. Первая мне нравится менее, насколько известно, комиссия при переводе на ВМ поболее, к тому же счет в системе привязан к кредитной или дебетовой карте. А вот вторая, Liberty Reserve, пользуется большей популярностью. Люди, которые работают/зарабатывают в интернете, имеют счетик в этой системе, т.к. очень многие зарубежные сайты работают именно с этой системой. Слышал несколько раз, что эту систему взламывали, но как говорят - не надо заходить на "левые" сайты.
Как итог: считаю необходимым ставить не одну платежную систему как способ оплаты, это будет намного облегчать жизнь Вашим посетителям. Советую как минимум поставить две:
WebMoney и
Liberty Reserve.